Das Schneefernerhaus liegt in einer Höhe von 2650 m und damit gerade über der Schwellenhöhe von 2500 m, in der gesunde Menschen sich für einen Daueraufenthalt akklimatisieren müssen. Für Patienten mit Vorerkrankungen (z. B. Herz- oder Lungenerkrankungen) kann bereits diese Höhe ein Problem darstellen. Darüber hinaus ist der durchschnittliche Luftdruck am Schneefernerhaus äquivalent mit dem Kabineninnendruck der in Verkehrsflugzeugen herrscht. Auf Grund der Höhenlage ist die Station zudem deutlich geringer mit allergenen Pollen und bestimmten anthropogenen Luftschadstoffen belastet.
Damit stellt das Schneefernerhaus einen idealen Standort für höhenmedizinische und allergologische Studien, aber auch Flugtauglichkeitsuntersuchungen dar.